Родился 30 июня 1980 года в Нижнем Тагиле.

Окончил Академию русского балета им. А. Я. Вагановой.

В 1998–2009 гг. являлся солистом Санкт-Петербургского государственного академического театра балета под руководством Бориса Эйфмана, где исполнял ведущие партии.
В качестве приглашённого солиста выступал в Михайловском театре, Варшавской национальной Опере, театре им. Леонида Якобсона. С 2009 года – солист балета Мариинского театра.

С 2008 года Юрий работает как хореограф. Он осуществил постановки хореографических миниатюр и балетов:
«Золото осени» («Verba volant, scripta manent – слова улетают, написанное остаётся», 2008), проект памяти Георгия Алексидзе;
Parting (первые исполнители: Евгения Образцова и Владимир Шкляров на гала-концерте «Малахов и друзья», Берлин, 2008);
«Реквием Нарциссу», «История на бегу» (2009);
«Предчувствие весны» (на музыку А. Лядова, 2010);
«Завод Болеро» (на музыку М. Равеля, 2010);
Intensio (на музыку А. Маева, 2013).
В этих балетах сам хореограф также исполнял ведущие партии.

В 2012 году на сцене Большого театра в Москве состоялась премьера двухактного балета «Мойдодыр» в хореографии Юрия Смекалова (музыка Ефрема Подгайца).

В мае 2013 года Юрий Смекалов принимал участие в Гала-концерте, посвящённом открытию новой сцены Мариинского театра, – в программу вечера вошла хореографическая редакция балета Харальда Ландера «Этюды», осуществлённая Юрием Смекаловым. В июне того же года участвовал в проекте «Творческая мастерская Владимира Васильева», проходившем в рамках Платоновского фестиваля искусств в Воронеже, где представил хореографическую миниатюру «Джан» на музыку Александра Маева.

В августе 2013 года в Театрально-концертном зале Элизы Кабреры в Тескоко прошла премьера балета Юрия Смекалова Infinita Frida на музыку Александра Маева.

Сотрудничает с тренером Алексеем Мишиным и принимает участие в создании программ для спортсменов Сборной России по фигурному катанию. В 2003–2004 годах он работал хореографом программ Евгения Плющенко, а в 2008–2009 годах подготовил программы «Нарцисс» и «Отшельник» для фигуриста Артура Гачинского.

Лауреат ХI Международного конкурса артистов балета и хореографов в категории «Хореограф» (1-я премия, Москва, 2009).

Лауреат высшей театральной премии России «Золотая маска» в номинации «Лучшая мужская роль» в балете «Чайка» (Тригорин) в сезоне 2007–2008 гг.

Лауреат высшей театральной премии Санкт-Петербурга «Золотой софит» в номинации «Лучшая мужская роль в балетном спектакле» за главную партию в балете Анжелена Прельжокажа «Парк» (2011).

Лауреат VII международного конкурса хореографов и балетмейстеров под патронажем Всемирного совета танца ЮНЕСКО в номинации «видео балет» (I премия, Новосибирск, 2012).

Награждён медалью «В память 300-летия Санкт-Петербурга».

Член клуба с 2013 года