Родился 14 июня 1951 года в Иркутской области в семье военного.

Окончил исторический факультет Горьковского государственного университета и постановочный факультет во ВГИКе.

По рекомендации А. Тарковского был зачислен в штат киностудии «Ленфильм». Одновременно сотрудничал с Ленинградской студией документальных фильмов. До конца 80-х ни один из фильмов режиссёра не был разрешён к показу советской цензурой. На протяжении 20 лет интенсивно работает, снимая несколько картин в год. Неоднократный призёр международных кинофестивалей.

На основе съёмочной группы Сокурова на «Ленфильме» создана студия «Берег» — предприятие некоммерческого документального и игрового кино.

По решению Европейской киноакадемии в 1995 году включен в число ста лучших режиссеров мирового кино.

Член клуба с 2002 года.